Typage de Pseudomonas aeruginosa chez des patients fibrose kystiques

Pseudomonas (P). aeruginosa est une bactérie pathogène opportuniste responsable de 90% de morbidité et mortalité chez les personnes atteintes de fibrose kystique (PFK). Ce pathogène a tendance à perdre les réponses au typage par des phages, des pyocines, de l'antigène (LPS) et à devenir souvent résistant à plusieurs antibiotiques. Ceci rend impossible le typage d'un grand nombre de souches et entraîne la perte de ces marqueurs épidémiologiques habituellement utilisés, constituant ainsi un défi particulier pour les méthodes de typage conventionnelles. Dans la présente étude, 60 souches non répétitives de P. aeruginosa isolées des PFK, ont été d'abord caractérisée selon leur antibiotype, leur biotype et leur sérotype. Ensuite une méthode (RAPD) a été mise au point, pour comparer les phénotypes des souches non sérotypables (n = 35). L'analyse RAPD de ces souches a permis de démontrer la présence de 30 souches avec des génotypes uniques. Les génotypes similaires sont répartis sur deux petits groupes clonaux (6% et 8%) pour chaque amorce. Aucune corrélation significative n'a été observée entre les profils RAPD et les antibiogrammes, ni entre les antibiogrammes et les morphotypes.