Ecologie moléculaire d'un sol Tunisien

Les travaux présentés dans ce manuscrit ont pour objectif de mieux comprendre l’effet de la pratique agricole, la végétation et les facteurs environnementaux, notamment la salinité, sur la diversité bactérienne de la microflore bactérienne totale du sol et des fractions nodulantes et totales des populations de rhizobium spécifiques du genre Medicago. En conclusion, la description des deux sols a été effectuée en combinant différentes approches. La communauté cultivable des bactéries hétérotrophes et rhizobiennes du sol salin s’est avérée plus diversifiée plus hétérogène et plus apte à tolérer de fortes concentrations de NaCl que le sol agricole. L’analyse de la biodiversité des communautés eubactériennes, rhizobiennes et de S. meliloti a permis de les classer selon le type du sol. L’utilisation de la T-RFLP, de la PCRq et le développement des marqueurs nodC, rpoE1et IGS-mel permettant la détection spécifique de S. meliloti directement du sol, ont bien confirmé que la communauté totale est plus abondante et plus diversifiée que la fraction nodulaire.