Diversité phenotypique et genotypique de salmonelles

Dans notre étude, onze marqueurs contenant des régions de répétitions en tandem polymorphique sélectionnés à partir du génome de S. enterica Typhimurium LT2, ont été utilisés pour évaluer la diversité génétique de 206 S. enterica sélectionnées à Phnom Penh, entre 2001 et 2007, représentées par 31 sérotypes, et sont isolées à partir de trois sources: hommes, aliments cuits et crus. La technique MLVA a permis de sous typer 107 génotypes regroupés dans un dendrogramme en deux branches distinctes dont la première et constituée par Salmonella Typhi et la deuxième par les 30 autres sérotypes. La représentation de la variation allélique des sérotypes de S. enterica a utilisé l’arbre minimum couvrant sans racine. Des variations alléliques pour des sérotypes de S. enterica ont été identifiées et des variants génétiques ont été répartis en variants MLVA à loci uniques, en variants différents par un locus, en variants différents par deux loci et des variants différents par plus de deux loci. Quatre marqueurs ont présenté un indice de diversité élevé (DI> 0,80). En résumé, la technique MLVA peut appliquée pour étudier le profil génétique de S. enterica avec une grande diversité de sérotypes.