Génomique du sorgho au niveau mondial et à l'échelle régionale du Mali

Le sorgho est une céréale annuelle essentiellement autogame, domestiquée dans la partie Nord-Est de l’Afrique subsahélienne. Elle est la 5ème céréale mondiale en termes de production. Le document présente en introduction l'historique de la domestication du sorgho et quelques notions utilisées pour les études d'association entre variations de caractères d'intérêt agronomique et polymorphisme moléculaire, la notion de déséquilibre de liaison (DL) en particulier. Un millier de marqueurs moléculaires présentés en seconde partie ont été utilisés pour décrire la structure génétique et l'étendue du DL d'une Core collection mondiale de 210 sorghos cultivés et d'une collection malienne composée de 420 variétés locales et de 80 sorghos sauvages en parties trois et quatre. La morphologie de la panicule définit des races qui combinées à l'origine géographique des accessions permettent d'expliquer les groupes génétiques du sorgho. Cette structuration induit un DL global important entre marqueurs non liés. Le DL local entre marqueurs proches est faible. La cartographie de facteurs génétiques par étude d’association nécessitera d’augmenter encore le nombre de marqueurs à plusieurs milliers.