La RNase Y, une nouvelle endoribonucléase essentielle chez B. subtilis

La stabilité des ARNm est un moyen efficace pour contrôler l’expression des gènes chez les bactéries. Nous avons étudié ce phénomène chez Bacillus subtilis, qui possède une panoplie de ribonucléases différente de celle d’E.coli. Au cours de cette étude nous nous sommes intéressés à la dégradation des ARNm de la famille des gènes à S-box qui sont régulés par un riboswitch sensible à la SAM. L’initiation de la dégradation de ce transcrit dépend de l’expression d’une protéine essentielle de fonction inconnue, YmdA. Nous avons caractérisé cette protéine comme étant une nouvelle endoribonucléase que nous avons appelé la RNase Y. L’activité de cette nucléase est stimulée par la présence d’un monophosphate à l’extrémité 5’ de l’ARNm. Par ailleurs, la déplétion de cette ribonucléase augmente la demi-vie des ARNm totaux d’un facteur supérieur à deux, indiquant que la RNase Y pourrait être une enzyme primordiale pour l’initiation de la dégradation des ARNm. Ceci suggère que la dégradation de l’ARNm pourraient être plus similaire entre B. subtilis et E.coli, avec notamment un rôle crucial pour un clivage endonucléolytique dans l’initiation de la dégradation de l’ARNm dans les deux organismes.